合肥工业大学档案馆成立于1983年，为校直属机构，正处级建制。现下设综合事务科、业务指导科、管理利用科3个科室。各室的主要职能如下：

      综合事务科职责
　　（1）负责档案馆的文秘工作、保密工作和报刊、杂志的征订、收发工作。
　　（2）负责档案馆资产、办公用房和用品的日常管理工作，负责档案馆日常办公经费开支和出国学籍证明材料的收费等工作，协助档案    库房的安全防范工作。
　　（3）负责档案馆各类会议的筹备和会务工作。
　　（4）负责档案馆统计报表的上报工作，档案馆的对内对外联络、接待工作和宣传报道工作。
　　（5）负责档案馆的工会小组工作，组织开展各项文娱活动。
　　（6）协助档案馆领导班子对人员的日常管理工作和专、兼职档案人员的业务培训工作。
　　（7）协助《年鉴》的编撰工作，负责组稿联络、编辑发行等工作。
　　（8）协助档案馆局域网的维护工作。
　　（9）负责学校和档案馆临时交办的其他工作。

     业务指导科职责
　　（1）负责制订业务指导科年度或学期工作计划，撰写工作小结；参与讨论、制订档案馆聘期、年度或学期工作计划。
　　（2）负责组织开展档案的宣传工作，做好兼职档案人员的业务培训、指导，监督、检查校内各单位的档案工作。
　　（3）负责制定和修订学校各类档案工作规范。
　　（4）负责业务指导科的各项任务分工，明确具体工作要求。
　　（5）负责组织开展学校各类档案的收集（征集）、整理、编目、归档工作。
　　（6）负责业务指导科人员的日常考勤、管理和年度考核工作。
　　（7）负责组织完成学校和档案馆临时交办的其他工作。

   管理利用科职责
    （1）负责制订管理利用科年度或学期工作计划，撰写工作小结；参与讨论、制订档案馆聘期、年度或学期工作计划。
    （2）负责制定和修订各类档案利用工作规定。
    （3）负责管理利用科的各项任务分工，明确具体工作要求。
    （4）负责组织开展档案的接收、分类、编号、入库、保管等工作，编制检索工具。
    （5）负责组织开展各项档案利用服务工作。
    （6）负责组织开展档案编研材料的选题、编撰工作，馆藏档案的著录工作，开发档案信息资源和开放档案信息的发布工作。
    （7）负责档案库房的安全管理工作。
    （8）负责管理利用科人员的日常考勤和管理。
    （9）负责组织完成学校和档案馆临时交办的其他工作。